腸道功能紊亂主要臨床癥狀為腹痛、腹脹、腸鳴音、不規則便秘和腹瀉交替出現，可能為水樣便、糊狀便、黏液便，且便后仍有便意。左下腹痛時可捫及條索狀腫物，腹痛常因進食后加重，在排便、排氣、灌腸后減輕。可伴有胃腸道外植物神經功能紊亂的癥狀，如焦慮、緊張、失眠、心悸、手足心熱、出汗、頭暈等。腸道功能紊亂需要遵醫囑使用調節腸道細菌藥物、止瀉藥物、通便藥、解痙藥、鎮靜藥、促胃腸動力藥物等。
1、調節腸道細菌藥物：如地衣芽孢桿菌、復方嗜酸乳桿菌片、雙歧桿菌等，可以調節腸道的細菌比例，緩解胃部不適的癥狀；
2、止瀉藥物：如是腹瀉，可使用止瀉藥物治療，如蒙脫石散、鹽酸洛哌丁胺膠囊、顛茄磺芐啶片等，可緩解腹瀉的癥狀；
3、通便藥：當出現便秘時，可以使用通便藥，如六味安消片、乳果糖、聚乙二醇等藥物增加胃腸道蠕動，促進排便；
4、解痙藥：如出現腹痛，可使用解痙藥物，如顛茄、普魯本辛、山莨菪堿、甲氧氯普胺等藥物緩解癥狀；
5、鎮靜藥：如出現植物神經功能紊亂，可以使用氯氮卓、氯丙嗪等藥物改善癥狀；
6、促胃腸動力藥物：如胃動力不足，導致不適癥狀，可使用西沙必利、伊托必利等藥物促進胃腸蠕動，緩解腸道紊亂癥狀。
導致腸功能紊亂的常見原因包括飲食不規律、不良情緒、消化不良、胃炎等，所以平時要進行飲食調整，多補充膳食纖維、水分，加強腸道蠕動，盡量少吃辛辣等刺激性的食物，避免飲酒、吸煙。如果是由于心理因素導致腸道功能紊亂，可通過適當鍛煉緩解不良情緒，也可以進行心理咨詢，以緩解腸道功能紊亂的癥狀。