清潔內度不好會導致非典型鱗狀細胞不明確，通常清潔度不好之后會引起陰道內的炎癥，而炎癥會導致細胞變異，從而引起非典型鱗狀細胞不明確。
清潔度不好還會引起陰部分泌物增多以及外陰部瘙癢的癥狀，需要及時到醫院做分泌物檢查，在經過檢查之后，如果是陰道內菌群失調引起的炎癥，必要時可以在醫師指導下通過局部使用甲硝唑栓劑、乳酸桿菌膠囊等藥物治療。
清潔度不好在用藥治療期間可以促使陰道內的炎癥基礎，從而使非典型鱗狀細胞不明確的情況得到改善。