臨床上并無難以鑒別的腎癌和腎囊腫最可靠的檢查方法，通常可通過腎動脈造影、CT檢查、病理活檢等方式進行鑒別診斷。
1、腎動脈造影：腎動脈造影用于疑難病例的診斷。腎癌作為惡性病變，在動脈期上表現(xiàn)為多血管性占位病變，?？梢娫龃衷龆嗪臀蓙y的腫瘤血管，或由于動靜脈瘺伴有腎靜脈早期顯影。而腎囊腫屬于良性病變，一般無上述表現(xiàn)。
2、CT檢查：作為惡性病變，腎癌本身可出現(xiàn)浸潤、轉(zhuǎn)移的現(xiàn)象，可導致周圍淋巴結(jié)損傷，出現(xiàn)腫大的現(xiàn)象，此時進行CT檢查可見腫大的淋巴結(jié)組織或是轉(zhuǎn)移的病灶。而腎囊腫病灶通常較為局限，一般并不會累及周圍淋巴結(jié)或是發(fā)生轉(zhuǎn)移。
3、病理活檢：該檢查主要是在局部出現(xiàn)腫瘤疾病，還不明確性質(zhì)時進行，主要是取得腫瘤組織細胞，觀察細胞形態(tài)，有效地辨明腫瘤的性質(zhì)、分期。臨床上該檢查也可用于難以鑒別的腎癌和腎囊腫，進行鑒別診斷。
需注意的是，單一的檢查并不能較好的對病情進行鑒別診斷，臨床上還可以配合腫瘤標志物、腎功能檢查等方式，方便進一步明確病因、病情，方便采取合理的治療措施。