甲溝炎在腳趾甲根部的患者在治療時，可以選擇局部處理、口服抗生素類藥物等方式治療，若癥狀嚴重，可以選擇甲溝切開引流手術或拔甲手術進行治療。
1、局部處理：甲溝炎多數是因為指甲部位受到外傷導致，外傷后易受致病菌感染，在病情早期可以選擇使用碘伏消毒，避免局部感染，傷口消毒后，可以選擇魚石脂軟膏來治療；
2、口服藥物：若局部組織出現感染，可以選擇抗生素類藥物治療，常用藥物包括甲氧芐啶片、阿莫西林膠囊等，可逐漸控制感染；
3、切開引流手術：如果腳趾甲根部出現膿腫，則建議選擇切開引流手術，有利于傷口愈合，手術時可以在兩側甲溝部位做縱行切口，將膿液引流出體外，術后需要注意局部傷口衛生，避免感染加重；
4、拔甲手術：若甲溝炎在腳趾甲根部的癥狀比較嚴重，可能需要進行拔甲手術，手術時需要進行麻醉，將部分或全部指甲拔除，因術后創面較大，容易被感染，所以要做好傷口部位護理。