馬齒莧的主要副作用包括可能導致腹部疼痛、腹瀉或孕婦流產等問題，但馬齒莧通常是無毒的，一般不會引起中毒。
馬齒莧被廣泛認為是一種常見的中草藥。如果馬齒莧的使用方法不恰當，也可能導致某些不良反應。馬齒莧具有寒性特點，如果大量食用或者是脾胃虛寒的人食用，很容易引發腹痛和腹瀉。這是因為馬齒莧損害了人體的陽氣，但這并不意味著馬齒莧是有毒的。另外，長期服用馬齒莧可能誘發腸胃病等疾病。患有滑腸泄瀉的人食用之后，泄瀉的情況可能會變得更為嚴重。馬齒莧能夠刺激女性的子宮平滑肌，因此孕婦在使用時容易導致滑胎，所以孕婦應避免使用。
馬齒莧的味道偏酸、性質偏寒，與肝、大腸經有關，并具備清熱、解毒、涼血和止血的特性。僅依賴單一的藥物是無法實現治療效果的，如果需要用藥，建議在專業醫生的指導下進行。