長出來的指甲凹凸不平，可能是甲營養不良、真菌感染、銀屑病累及指甲、外傷、其他系統性疾病等原因引起的，建議及時就醫并遵醫囑治療。
1.甲營養不良：由于飲食中缺乏蛋白質、維生素、鈣、鐵等營養物質，或者長期患有消化系統疾病影響營養吸收，指甲生長所需的原料不足，導致甲板結構異常，出現凹凸不平。可通過調整飲食結構，保證營養均衡，多吃富含蛋白質的食物，包括瘦肉、魚類、豆類，以及新鮮蔬果。同時可口服多維元素片、復合維生素B片、葡萄糖酸鈣鋅口服溶液補充營養，促進指甲恢復正常。
2.真菌感染：皮膚癬菌等真菌侵犯甲板，在甲板內生長繁殖，破壞甲板的正常結構和角質形成過程，使指甲表面變得粗糙、凹凸不平，還可能伴有變色、增厚等癥狀。可外用抗真菌藥物，包括鹽酸阿莫羅芬搽劑、環吡酮胺乳膏，能滲透甲板發揮作用；口服抗真菌藥如伊曲康唑膠囊、鹽酸特比萘芬片，但口服藥需注意監測肝功能，適用于病情較重或外用效果不佳者。
3.銀屑病累及指甲：銀屑病是一種自身免疫性疾病，當累及指甲時，甲床的角質形成細胞增殖異常，導致指甲生長異常，出現點狀凹陷、橫溝、縱嵴等凹凸不平的表現，還可伴有指甲變色、剝離等。可外用卡泊三醇搽劑涂抹指甲及甲周皮膚，口服阿維A膠囊調節細胞分化，但阿維A膠囊副作用較多需密切觀察，還可配合紫外線光療改善癥狀。
4.外傷：指甲受到擠壓、撞擊等外傷后，甲板下的組織可能受損，影響指甲的正常生長，新長出的指甲可能出現凹凸不平。應注意保護指甲，避免再次受傷。一般輕度外傷無需特殊用藥，若有淤血或疼痛，可口服三七傷藥片活血化瘀，外用云南白藥氣霧劑消腫止痛，待指甲自然生長更替后可恢復正常。
5.其他系統性疾病：如貧血、甲狀腺功能亢進或減退等疾病，會影響身體的代謝和血液循環，進而影響指甲的生長發育，使其凹凸不平。需要積極治療原發疾病，如缺鐵性貧血可口服硫酸亞鐵片、琥珀酸亞鐵片補鐵，甲狀腺功能異常則需在專科醫生指導下進行相應的藥物治療，如甲狀腺素片或抗甲狀腺藥物，隨著原發疾病的控制，指甲情況可能逐漸改善。
使用上述藥物時一定要嚴格遵照醫囑。日常護理要注意保持指甲清潔，避免過度修剪指甲，不要使用劣質的指甲油和美甲產品，防止對指甲造成進一步損傷。