得了肺部真菌感染后，是否能夠治愈不能一概而論，需要根據真菌感染的嚴重程度、是否能夠及時接受治療，以及患者身體素質等多種因素決定。通常情況下早發現、早診斷、早治療，治好的可能性也就相對越大。
1、輕癥：通常情況下，感染較輕微、累及范圍和器官較少的原發性肺部真菌感染，在患者能夠積極配合醫生接受治療的情況下，多數患者的感染可以被控制，甚至清除，臨床認為可達到治愈的程度；
2、重癥：若患者本身體質較弱，或未及時接受治療，導致感染蔓延范圍較大，以致并發肺炎、肺栓塞、肺膿腫等多種并發癥時，即使積極治療，也可能存在一定危險性，無法保證一定能治好，此時屬于相對嚴重的情況。
肺部真菌感染到后期可出現多種并發癥，此時治好的可能性也比較低，而且治療時間也會相對較長。因此確診為肺部真菌感染后應積極接受治療，患者可在醫生指導下選擇抗真菌類藥物，如多烯類抗真菌藥物、三唑類藥物、棘白菌素類藥物等，以便盡快控制病情，提高預后。