手術止痛泵可能會有副作用，主要包括抑制心肺功能、胃腸道不適、過敏反應等。
1、抑制心肺功能：手術止痛泵主要有硬膜外止痛泵以及靜脈止痛泵，是一種將止痛藥物自動定量注入患者體內的設備。可能會作用于呼吸中樞，引起呼吸抑制，還可能造成心肌抑制、傳導阻滯，導致血壓下降、心率減慢等，使患者出現嗜睡等癥狀。
2、胃腸道不適：止痛藥使用后可能會影響胃腸道神經，抑制胃腸道蠕動，從而導致患者出現惡心、嘔吐、腹瀉等胃腸道反應。
3、過敏反應：如果患者體質較敏感，對于手術后止痛泵中的止痛藥過敏，可能會出現過敏反應，患者可出現皮疹、蕁麻疹，并伴有瘙癢，嚴重時可造成咽喉水腫等。應該立即停藥，在醫生評估下換藥治療。
此外還可能出現麻痹膀胱神經、出現成癮性、行動限制的副作用。