苦參凝膠推完后管子可以馬上取出，對人體并無重大影響，而且該管子屬于一次性物品，不可在陰道內停留時間過長，避免感染發生。苦參凝膠的用法為將苦參凝膠管注入陰道深處，緩緩推入藥物，推完藥物后管子可取出，通常藥物不會流出。如果擔心夜間睡眠時無意識翻身，可能導致少量藥物流出甚至污染衣褲，則可墊上護墊再睡覺，有利于防止藥物漏出。
苦參凝膠是以苦參堿為主的膠凍狀水溶性凝膠，苦參堿可有效抑制細菌生長，明顯清除宮頸充血、水腫、黏膜糜爛，減少分泌物增加，因此苦參凝膠對于宮頸糜爛、細菌性陰道炎及陰道霉菌感染等婦科慢性炎癥有一定治療效果。但是需要注意，在經期不可應用此藥，另外未婚女性應在醫生指導下使用。如果對于苦參堿過敏的人群，建議慎用，避免發生陰道紅腫、瘙癢等過敏反應。