通常糠秕孢子菌毛囊炎很難根治，但合理治療可以改善不適癥狀。
糠秕孢子菌毛囊炎是由糠秕馬拉色菌引起的毛囊炎性損害，糠秕馬拉色菌是一種真菌，通常存在于正常人的皮膚表面，但在某些特定條件下，如油脂分泌旺盛、多汗、免疫力下降等，會過度繁殖，侵入毛囊，引發炎癥反應。之所以說很難根治，主要是因為這種真菌容易在適宜的環境下再次活躍。而且糠秕孢子菌毛囊炎的復發還可能與患者的個體易感性、生活習慣、基礎疾病等因素有關。例如，有些人的皮膚特質使得他們更容易受到糠秕馬拉色菌的侵襲。此外，如果患者不能很好地控制油脂分泌、保持皮膚清潔干燥，或者存在糖尿病等影響免疫力的基礎疾病，都可能導致病情反復。對于糠秕孢子菌毛囊炎患者，需要注意遵醫囑堅持治療，即使癥狀緩解也不能隨意停藥。其次應該注意個人衛生，勤洗澡、勤換衣物，選擇透氣性好的衣物。在飲食方面，要少吃辛辣、油膩和甜食，經過合理治療，可以輔助控制病情。
此外，患者恢復期間如果出現不良癥狀，應該及時前往正規醫院就診處理。