胚胎移植第六天，半夜咳得很厲害可能會影響著床，也可能不會。
胚胎移植是試管嬰兒過程中非常重要的一步，它是將體外受精后形成的胚胎移植入子宮腔，從而幫助女性妊娠的一項輔助生殖技術。咳嗽本身對胚胎移植的影響可能不大，所以如果只是偶爾的咳嗽，一般不會造成較大的影響。但是劇烈咳嗽可能會對子宮產生壓力，從而影響胚胎著床。在胚胎移植后，保持良好的作息規律、充足的休息以及保持平和的心態對胚胎著床有一定幫助。
如果擔心咳嗽會影響胚胎著床，建議及時咨詢專業的醫生。同時，保持良好的生活習慣、飲食均衡、適當運動和充足的休息也有助于胚胎著床。