三代試管即試管嬰兒輔助生殖胚胎植入前遺傳學篩查，三代試管寶寶大部分染色體或基因缺陷導致的疾病可以有效避免，但影響最終妊娠結局的因素還包括技術因素、孕期因素等，因此并不能保證寶寶出生后沒有缺陷。
1、技術因素：三代試管主要是通過取少量胚胎細胞，對胚胎的染色體或基因進行分析，篩選出正常的胚胎進行移植。染色體或基因缺陷導致的疾病有成千上萬種，目前三代試管技術只能篩選出常見的基因或染色體疾病，目前技術水平尚不能將所有的基因或染色體疾病全部篩查出來，因此三代試管寶寶還是可能會有缺陷；
2、孕期因素：胚胎在孕期可能會受到外界影響，如煙酒刺激、有毒有害物質刺激、射線、病毒感染、母體血糖、血壓異常等因素，都可以導致胚胎或胎兒發育受到影響，即便是移植經過三代試管篩選的優質胚胎，也可能會有出生缺陷。
出生缺陷的問題屬于概率問題，大部分經過三代試管篩選的胚胎移植后都能取得較為滿意的妊娠結局。因此調整好心態，不必為尚未發生的事情而焦慮，保持良好心態有利于降低出生缺陷發生的概率。