睡覺睡醒了頭疼可能是睡眠質量差、神經性頭痛、腦動脈硬化等原因引起，可根據患者頭痛的原因到醫院進行檢查，根據原因對癥治療。
1、覺睡醒了頭痛和睡眠不足有一定的關系，比如經常性的熬夜、大腦過度疲乏、睡眠時間短會影響睡眠，造成睡眠質量差，睡眠時間短，則會引起大腦無法好好休息，睡醒之后不解乏，患者則會出現頭痛的癥狀。可以適當調整睡眠環境，盡量處于安靜的環境中，同時也要改善不良的生活方式，避免經常性熬夜，養成良好的睡眠作息，必要時可在醫生指導下口服安神補腦液、甲鈷胺片等藥物進行調理。
2、睡覺睡醒了頭痛也可能是神經性頭痛，可能是精神緊張所引起，精神高度緊張中患者在睡覺時得不到放松，頭皮肌肉和筋膜會發生收縮，可能會引起頭部有壓迫感、沉重感，睡醒后會感覺頭痛。可以在醫生指導下口服艾司唑侖片、氯硝西泮膠囊等藥物進行治療，能夠緩解肌肉緊張，平時也要做好自我調整進行減壓。
3、腦動脈硬化也可能會引起睡覺睡醒了頭痛的癥狀，腦動脈硬化大多和高血壓、高血脂有一定關系，腦動脈硬化后動脈的舒張功能和收縮功能會發生障礙，影響腦部的血流。可在醫生指導下口服阿司匹林腸溶片、氯吡格雷膠囊、舒瑞伐他汀片等藥物，能夠延緩血管硬化，平時應該保持低鹽、低脂的飲食方式。