枸櫞酸氯米芬和來曲唑的區別通常是作用機制不同、適應證不同、副作用不同、對激素水平影響不同、藥物代謝不同等，患者應在醫生的指導下用藥。
1、作用機制不同：枸櫞酸氯米芬通常是通過競爭性結合下丘腦雌激素受體，使下丘腦認為體內雌激素水平較低，從而解除雌激素對下丘腦-垂體軸的負反饋抑制，促使垂體分泌促性腺激素，刺激卵泡發育。來曲唑為芳香化酶抑制劑，主要是抑制雄激素向雌激素的轉化，降低體內雌激素水平，減弱雌激素對下丘腦-垂體軸的負反饋，使促性腺激素分泌增加，進而促進卵泡生長。
2、適應證不同：枸櫞酸氯米芬常用于多囊卵巢綜合征患者，也用于下丘腦-垂體機能障礙引起的閉經、無排卵性月經和黃體功能不全等導致的不孕癥。來曲唑除了用于排卵障礙性不孕癥外，也可以輔助治療乳腺癌。
3、副作用不同：枸櫞酸氯米芬常見的副作用有潮熱、腹脹、腹痛、乳房不適、惡心、嘔吐等，還可能出現視覺異常，如視物模糊、復視等。來曲唑的副作用主要包括惡心、頭痛、骨痛、潮熱等，由于其降低雌激素水平。
4、對激素水平影響不同：枸櫞酸氯米芬在促進卵泡發育過程中會使體內雌激素水平升高，而且可能影響子宮內膜厚度。來曲唑主要是降低雌激素水平，對子宮內膜的影響相對較小，但可能會因雌激素水平下降而在一定程度上抑制子宮內膜生長。
5、藥物代謝不同：枸櫞酸氯米芬主要在肝臟代謝，經過氧化、去甲基化等過程，其代謝產物主要通過糞便排出體外。來曲唑在體內主要通過肝臟的細胞色素P450酶系進行代謝，大部分代謝產物經腎臟排泄，少量經膽汁排泄。
如果患者正在使用這兩種藥物，應嚴格遵循醫囑，密切觀察身體反應。