克林霉素磷酸酯凝膠主要用于治療尋常痤瘡，而甲硝唑凝膠主要用于治療炎癥性丘疹、膿皰瘡，以及酒渣鼻紅斑等皮膚疾病。由于兩種藥物的藥品說明書上均提及，如果與其他藥物同時使用可能會發生藥物相互作用，因此應盡量避免一起用，或者嚴格遵醫囑一起用，以免藥物之間相互作用，而對身體健康造成不利影響。
克林霉素磷酸酯凝膠具有抗需氧菌和厭氧菌的作用，對于痤瘡丙酸桿菌具有較強的抗菌性，有利于減少面部皮脂溢出。但是由于應用該藥物可能會引起胃腸不適、腹瀉等不良反應，所以有腸炎或潰瘍性結腸病史的患者應禁用。而甲硝唑凝膠僅具有抗厭氧菌的作用，作用機制是阻礙細菌代謝，促使其死亡。由于應用該藥物可能會引起皮膚干燥、燒灼感等過敏反應，因此對該藥物過敏的患者也應禁用。