一般情況下，腐乳曲粉對身體并沒有害處，但是建議腎臟功能異常患者、痛風患者、腸胃功能異常的患者少吃或不吃。
腐乳曲粉是由豆制品制作而成，含有豐富的不飽和脂肪酸、各種必需的氨基酸，日常吃腐乳曲粉可以排除身體多余水分，有除濕、健脾的功效。腐乳曲粉中的蛋白質成分可以和膽酸互相結合，降低對膽酸的再吸收以及對膽固醇的吸收。對于高血壓和動脈硬化的患者，吃腐乳曲粉可以降低體內血脂含量，達到降血壓、疏通血管的作用。腐乳曲粉還有開胃消食的作用，可以通過吃腐乳曲粉來提高食欲。腐乳曲粉中嘌呤含量較高，進入體內后，需要分解成尿酸排出體外。腎臟功能異常的患者需要少吃腐乳曲粉，以免加重腎臟負擔。如果體內尿酸過高，無法及時排出，會引發痛風，建議痛風患者少吃。腐乳曲粉發酵后容易被微生物感染，腸胃功能異常的患者食用后容易誘發胃炎、胃潰瘍等疾病。
在日常生活中，需要選用密封性較好的玻璃容器來裝腐乳曲粉，吃的時候選用干凈、干燥的筷子夾取，開封后最好放入冰箱保存。