中醫認為凌晨五六點咳嗽厲害可能是肺陰虛或者肺熱導致的，一般可以選擇口服中成藥、用中藥材泡水喝、中藥貼敷穴位等方式來治療，具體分析如下：
1.口服中成藥：凌晨五六點咳嗽厲害，可以口服蘇黃止咳膠囊、養陰清肺丸、川貝枇杷膏等中成藥來治療，具有止咳或者清肺熱的作用。
2.用中藥材泡水喝：凌晨五六點咳嗽厲害的患者可以用胖大海、羅漢果、金銀花等中藥材泡水喝，具有利咽、清熱潤肺的作用。
3.中藥貼敷穴位：可以選擇中藥貼敷穴位的方法來緩解凌晨五六點咳嗽厲害的癥狀，具體的穴位包括天樞、膻中、大椎以及雙側的肺俞等。