特發性矮小指特發性矮小癥，目前對于特發性矮小癥的治療有一定爭議，治療該病的主要方法，首先利用重組人生長激素給予治療，其次可以運用促性腺激素釋放激素，對青春發育期的特發性矮小癥患兒進行治療，也可以使用芳香酶抑制劑進行治療。
如果診斷為特發性矮小癥，需要及早使用重組人生長激素進行治療，對患兒生長較為有利，但可能會對心功能發育有一定影響。如果治療較晚，比如骨骺線已經愈合，此時使用重組人生長激素效果通常較小，可能會延誤治療。而促性腺激素釋放激素主要用于青春發育期的患兒，目的是抑制過早的性發育，延緩骨齡發展，改善其身高。另外芳香酶抑制劑可以延緩骨骺最終融合，達到促線性生長的目的。
特發性矮小癥的患兒在應用生長激素等藥物治療過程中，需要檢測甲狀腺功能，防止出現甲狀腺功能減退癥狀，同時需要關注身高增長幅度。除應用藥物外，家長應該提供良好的成長環境，也可以讓患兒適當運動，如慢跑、打籃球、游泳等，同時注意平時飲食均衡，多攝入富含鈣、優質蛋白質的食物，例如魚、蝦、牛奶等，還需要保持充足的睡眠，這些措施都對長高有一定的輔助效果。