腳底上有一個一個小洞可能是真菌感染，也可能是細菌感染，還可能是受到了病毒感染而引發的。需要積極就醫檢查，找到原發病因之后對癥治療。
1、真菌感染：比如腳癬，一般是平時不注意個人衛生，受到了真菌感染所引起的病變，局部可出現疼痛以及瘙癢，還會引起腳底上有一個一個小洞，需要通過抗真菌藥物治療，比如克霉唑軟膏等；
2、細菌感染：比如窩狀角質松解癥，通常是細菌感染導致的，早期會出現明顯的氣味，類似于腳氣，后期會導致角質層剝脫，表現為腳底上有一個一個小洞，建議遵醫囑口服阿莫西林膠囊等藥物進行治療，同時可配合局部涂抹莫匹羅星軟膏治療；
3、病毒感染：如果自身抵抗力下降，或者是長時間不更換鞋子的情況下，可能會受到病毒感染。比如受到帶狀皰疹病毒感染等，也會對腳底的皮膚產生刺激，導致腳底上有一個一個小洞。可以通過利巴韋林片等抗病毒藥物進行治療，能幫助癥狀逐漸得到好轉。
建議患者在日常生活中保持個人衛生，避免受到感染，飲食上要以清淡為主，不要吃辛辣刺激性食物，以免影響疾病恢復。