兒保科通常指兒童保健科，通常存在于分科較細的大醫院，屬于兒科眾多科室中的一個。兒科則是一大類，較小的醫院不進行分科，兩者的主要區別在于側重點不同，其中兒童保健科重在疾病預防，兒科重在疾病治療，但兩者也有一定的交叉。
1、兒童保健科：該科負責收集、整理、分析和利用兒童健康狀況，從而了解兒童的生長發育、營養、心理、行為、智力、人格發育等，包括兒童生長發育狀況、營養狀況、心理和行為狀況、智力和個性發展狀況，是一種全方位的兒童綜合保健科室。兒童保健科屬于兒科的一個分支，但實際工作中，兒童保健科屬于疾病的預防科，負責監測兒童的生理和心理的發育。兒童是一個處于不斷生長發育的機體，所患的疾病與成年人相比具有特異性，兒童的免疫功能比成年人差，容易被感染，因此做好疾病預防措施比較重要；
2、兒科：是指為兒童身體疾病提供治療方案，提高兒童身體、智力、適應能力等方面的生長發育水平的科室。兒童的身體各部分比例、器官大小和位置等隨年齡增長而改變，各系統、器官的功能隨年齡增長而成熟，因此對同一致病因素的反應隨年齡變化都有不同的表現，變化快、表達差、定位不明確是診斷兒童疾病的難點所在。兒科在實際工作中主要為兒內科，方向為疾病的診療，負責兒童疾病的診斷和治療。