三歲寶寶發生角膜炎后病情反復不好，通常與疾病治療不徹底、護理不當、局部因素等原因有關，患兒明確原因后可在醫生的指導下進行治療，平時保持眼部干凈衛生。
1、疾病治療不徹底：角膜炎可能與感染、自身免疫性疾病、角膜異物等因素有關，若寶寶第一次患有角膜炎時未治療徹底，病因未消除，可導致疾病總是反復，建議患兒查明病因治療，如角膜炎與病毒感染有關，可按照醫囑使用利巴韋林滴眼液、阿昔洛韋滴眼液等藥物進行治療，如果與細菌感染有關，可以使用復方硫酸新霉素滴眼液、妥布霉素滴眼液等藥物進行治療。
2、護理不當：如果家長在日常生活中不注意寶寶的用眼衛生，讓寶寶用臟手揉眼睛，可能使病原體或過敏原反復侵入眼表而導致角膜炎反復不好，此時家長除按照醫生指導積極治療角膜炎外，在日常生活中需要注意及時清潔寶寶的雙手，糾正寶寶揉眼的習慣。
3、局部因素：如果寶寶本身存在虹膜睫狀體炎、結膜炎等炎癥，可能因角膜鄰近的其他組織炎癥累及角膜，從而反復發作炎癥，因此家長需根據醫囑針對寶寶眼睛周圍疾病進行治療，如使用鹽酸奧洛他定滴眼液、氯雷他定糖漿等藥物進行抗過敏治療，使用小牛血去蛋白提取物眼用凝膠、重組牛堿性成纖維細胞生長因子眼用凝膠等藥物促進眼表修復等。
除上述原因外，如果寶寶本身存在免疫功能紊亂、遺傳因素、體質因素等，都可能導致角膜炎反復發作，建議家長帶寶寶到醫院小兒眼科就診，完善血常規、裂隙燈檢查、結膜分泌物涂片和刮片等檢查以明確病情，保持眼部清潔，禁止用臟手揉眼睛。