嬰兒大便有黑色雜質和奶瓣可能是胃腸炎引起的，也可能是消化不良導致，建議前往醫院，明確病因，對癥治療，具體如下：
1、胃腸炎：通常是一種胃腸道黏膜的急性炎癥，通常是接觸被病原微生物污染的食物或水所致。常表現為惡心、嘔吐、腹瀉、發熱、寒戰、頭痛等，可能伴有黏膜干燥、心動過速、皮膚彈性差、皮膚變暗、黑眼圈、玻璃狀眼睛等癥狀。需根據患者自身情況，在醫生的指導下通過慶大霉素、東莨菪堿、多潘立酮、莫沙必利等藥物進行治療。
2、消化不良：多是由于嬰兒牛奶蛋白過敏或者媽媽飲食導致的。可以去醫院檢驗一下嬰兒糞便里是否帶有細菌。消化不良多表現為腹脹、腹瀉、嘔吐和哭鬧等癥狀。媽媽要注意要調節飲食。可以在醫生的指導下通過服用腸道益生菌類的藥物進行調節。