先天性巨結腸，暫時不能在產檢的過程中檢查出來。
在產檢的過程中，一般需要進行女性B超檢測、血常規、羊水穿刺等檢查，可以通過上述檢查了解子宮內胎兒的手腳是否處于正常發育階段、自身基因是否出現異常變化、女性是否患有貧血等方面，可以通過產前檢查，判斷子宮內胎兒是否出現異常變化，以免對孩子自身發育產生影響。如果想要判斷是否患有先天性巨結腸等疾病，需要根據病人自身是否出現腹部劇烈疼痛、大便干燥、突然嘔吐以及腸道磁共振掃描成像、腸道CT掃描等方式進行診斷。
進行產前檢查的過程中，暫時無法通過上述檢查項目及時了解胎兒是否患有先天性巨結腸。