陰莖上有小蟲子一般和陰虱病、疥瘡等原因有關，建議及時就醫檢查了解具體情況。
1、陰虱病：這是一種由陰虱引發的寄生蟲感染疾病，主要寄生在外陰的毛發區域，由陰虱多次叮咬和吸血導致的瘙癢性皮膚疾病。因此，如果男性受到這種疾病的困擾，由于陰虱的寄生，陰莖可能會出現小蟲的癥狀。在治療過程中，可以按照醫生的建議去除外陰的毛發，并同時使用外部藥物，例如苯甲酸芐酯凝膠和林旦乳膏等。
2、疥瘡：這是一種由疥螨在皮膚上寄生引發的傳染病，人類疥瘡主要是由人疥螨導致的，可以通過顯微鏡進行觀察。在臨床上常表現為瘙癢和皮膚損害，患者多伴有畏寒肢冷，甚至體溫下降而影響正常生活。可能導致感染區域出現丘疹、丘皰疹、竇道和疥瘡結節等癥狀。臨床上應根據患者病情及全身狀況進行對癥處理。如果疥螨侵入陰莖區域，通過顯微鏡檢查，可以觀察到陰莖出現小蟲子的癥狀。在治療過程中，可以根據醫生的建議選擇外部使用的殺蟲藥，例如氧化鋅硫軟膏、硫軟膏和克羅米通乳膏等。
平時注意保持陰莖部位的干燥和清潔，有助于減少病原體的滋生。