陰莖皮下有很多疙瘩，可能是陰囊皮脂腺囊腫、珍珠狀陰莖丘疹、尖銳濕疣等原因引起的，患者可以根據病因采取對應的治療方式。具體分析如下：
1.陰囊皮脂腺囊腫：陰莖皮脂腺囊腫是由于陰莖部位的皮脂腺排泄通道被分泌物堵塞住，形成了潴留性的囊腫，可能出現陰莖皮下有很多疙瘩的癥狀。建議到當地醫院進行血常規、尿常規等檢查，明確病情，可以采取手術的方式進行治療，通常在囊腫中央沿著皮紋方面做一梭形切口，再將囊腫摘除。
2.珍珠狀陰莖丘疹：珍珠狀陰莖丘疹是以陰莖冠狀邊緣和冠狀溝出現珍珠狀、半透明丘疹為特征的皮膚病，可能出現陰莖皮下有很多疙瘩的癥狀。建議到當地醫院進行醋酸白試驗，明確病情?？梢詫崰栮幭匆号c生理鹽水配成一定比例濃度的液體，對患處進行清洗，還可以在患處涂抹氟尿嘧啶軟膏、莫匹羅星軟膏等藥物，緩解癥狀。
3.尖銳濕疣：尖銳濕疣是由人乳頭瘤病毒感染引起的常見性傳播疾病，可能出現陰莖皮下有很多疙瘩的癥狀，一般這種疙瘩是乳頭狀或者菜花狀。建議患者去醫院檢查，明確病因后，在醫生的指導下外用鬼臼毒素軟膏、咪喹莫特乳膏等藥物；還可以進行激光治療，一般能使較小的疣體脫落，從而達到緩解癥狀的目的。