陰莖根部長了個很痛的疙瘩可能是皰疹、毛囊炎、尖銳濕疣等原因引起的，需要前往醫院就診，明確病因后對癥治療，具體分析如下：
1.皰疹：陰莖根部長了個很痛的疙瘩可能是皰疹引起的，還可能表現為皮膚腫塊、瘙癢等?；颊呖梢栽卺t生的指導下使用阿昔洛韋乳膏、普瑞巴林膠囊等藥物進行治療。
2.毛囊炎：陰莖根部長了個很痛的疙瘩可能是毛囊炎引起的，還可能表現為皮膚腫塊、皮疹等。患者可以在醫生的指導下使用紅霉素軟膏、夫西地酸鈉軟膏等藥物進行治療。
3.尖銳濕疣：陰莖根部長了個很痛的疙瘩可能是尖銳濕疣引起的，還可能表現為皮膚皮疹、肛門菜花樣顆粒等。患者可以在醫生的指導下使用鬼臼毒素軟膏、重組人干擾素α2b凝膠等藥物進行治療。