學生三個月沒來月經了一般可以通過藥物治療、日常護理等方式進行處理。具體分析如下：
1.藥物治療：學生三個月沒來月經了一般可以通過藥物治療進行處理，可以在醫生指導下應用黃體酮膠囊、地屈孕酮片等藥物進行治療。需要注意的是，用藥不當可能會損害機體的健康，所以學生應當盡量避免自行用藥。
2.日常護理：學生三個月沒來月經了一般可以通過日常護理進行處理，學生應當積極調節自我情緒，近期飲食盡量以清淡、易消化為主，少吃辛辣、油膩等刺激性食物，注意休養，盡量避免熬夜以及過度疲勞。