乙型流感第三天開始拉肚子，通常是考慮是流感自身癥狀，也可能是合并其他疾病出現的癥狀，如急性胃腸炎、腸易激綜合征等。建議出現這種情況的患者及時就醫，遵醫囑接受治療。
1、流感自身癥狀：乙型流感病毒可能侵犯感染胃腸道，進而出現諸如腹瀉、腹痛、惡心、嘔吐等癥狀，會有乙型流感第三天開始拉肚子的癥狀表現。建議遵醫囑服用磷酸奧司他韋膠囊、磷酸奧司他韋顆粒等抗病毒藥物治療；
2、急性胃腸炎：乙型流感合并急性胃腸炎，也可能出現乙型流感第三天開始拉肚子的情況，癥狀主要有嘔吐、惡心、腹痛等不適，一般有不潔飲食史。可以遵醫囑服用地衣芽孢桿菌活菌膠囊調節胃腸道菌群，服用蒙脫石散止瀉治療；
3、腸易激綜合征：屬于功能性腸病，由各種因素誘發，可能導致腹痛、便秘與腹瀉交替出現。乙型流感病毒感染刺激后可能誘發腸易激綜合征的發作，導致出現乙型流感第三天開始拉肚子的情況。可以遵醫囑服用匹維溴銨片進行治療；
除此之外，治療乙型流感期間可能進行輸液或口服藥物治療，部分患者可能對所用的藥物產生不良反應，進而可能出現乙型流感第三天開始拉肚子的情況，大多停藥后癥狀會逐漸改善。