種睫毛眼睛疼可能與眼睛疲勞、局部刺激等因素有關，還有可能是患有角膜炎或者是結膜炎等疾病所致，可前往醫院進行檢查，以明確疾病，并對因治療，緩解不適癥狀。
1、眼睛疲勞：如果在種睫毛以后長時間地熬夜或者是使用電子產品，就有可能會導致眼部疲勞，會引起眼睛疼痛。需要注意保持充足的睡眠，緩解不適癥狀；
2、局部刺激：種睫毛的時候通常會在局部做一些微小的缺口，然后將毛囊種植在眼瞼的部位，可能會刺激眼部皮膚，所以在手術以后就有可能會使眼睛出現輕微的疼痛。可以做好眼部的護理措施，不要用手揉眼睛，一般在傷口恢復以后疼痛就會緩解；
3、角膜炎：角膜炎可能是因為長時間的使用隱形眼鏡或者是角膜異物等因素引起的，如果術后沒有做好護理措施，也有可能會誘發角膜炎，在炎癥刺激下會導致眼睛出現疼痛，而且還會引起怕光、流淚等癥狀。患者可以遵醫囑局部使用紅霉素眼膏、妥布霉素滴眼液等藥物治療，緩解不適癥狀；
4、結膜炎：結膜炎可能是種睫毛后護理不當，微生物感染引起或者和物理損傷有關，比如紫外線照射以及風沙刺激等因素導致，在炎癥刺激下會使眼睛出現疼痛，而且還會引起結膜充血、分泌物增多等癥狀。患者應注意休息，避免用眼過度，可遵醫囑使用左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液等藥物進行治療，治療期間要避免用手揉眼睛，促進疾病康復。