睡醒大腿根部內側疼痛可能是以下原因：
1、缺血性疼痛：
如睡姿不當導致大腿根部肌肉受到長時間壓迫，引起局部肌肉麻木缺血；下肢靜脈血液循環受阻，大腿根部出現血液栓塞，引起肌肉缺血疼痛。
2、運動：
前一天進行了跳遠、跑步、跳躍等運動，乳酸堆積在腿部，第二天引起的腿根部內側酸痛；過度活動大腿導致大腿肌肉勞損痙攣，引起大腿根部內側疼痛。
3、筋膜炎：
如大腿根部長期處于較潮濕的狀態，導致大腿根部內側肌肉出現無菌性炎癥，引起局部肌肉發生痙攣疼痛。