當患者患上傳染性軟疣且患處有很小的疣體存在時，可以從藥物治療、物理治療、手術治療等方面進行處理。
1、藥物治療：當患者局部皮膚發生傳染性軟疣時，可在醫生的指導下使用水楊酸軟膏、咪喹莫特乳膏、維A酸乳膏等藥物治療。這些藥物能夠調節局部皮膚組織的代謝，促進皮損的消退，用藥時要避免皮膚受到機械性損傷。
2、物理治療：患者可考慮進行激光、液氮冷凍、電灼等方式破壞患處的異常組織而去除疣體。物理治療能夠在短時期內達到明顯的治療效果，且不會對皮膚組織造成嚴重損傷，建議在正規的醫療機構進行操作。
3、手術治療：患者也可選擇到正規醫療機構就診后，由醫務人員使用專業器械將疣體夾除或切除，操作后要做好傷口部位的清潔和消毒工作，避免傷口繼發感染。