卵巢囊腫是一類疾病的統稱，但是并不是所有的卵巢囊腫都會出現激素升高，也可出現某種腫瘤標志物升高。因此并不用某一個激素指標評估所有的卵巢囊腫，卵巢囊腫可大致分為上皮性腫瘤、生殖細胞腫瘤、性索間質腫瘤、轉移瘤等。
1、上皮性腫瘤：大多伴隨有腫瘤標志物血清CA12-5（是一種糖類蛋白質）增高，漿液性及黏液性囊腺瘤可以伴隨雌激素的升高；
2、生殖細胞腫瘤：生殖細胞腫瘤中卵黃囊瘤的細胞會分泌腫瘤標志物，導致甲胎蛋白數值升高；
3、性索間質腫瘤：性索間質腫瘤中的顆粒細胞瘤、卵泡膜細胞瘤可刺激性激素分泌增多，可伴隨較高水平的雌激素；
4、轉移瘤：主要是其他部位轉移至卵巢導致，由于原發病灶來源多樣，主要依據原發病灶進行分析，不同部位的原發病灶可伴隨不同的腫瘤標志物升高。
卵巢囊腫還可以有其他類型，每種類型涉及的具體疾病也可能是多種的，比如生殖細胞腫瘤，可以包括無性細胞瘤、卵黃囊瘤、畸胎瘤等，通常主要通過手術的方式進行切除，切除后通過病理檢測判斷良惡性以及病理組織來源，再擬定后續的治療方案。