肺部有感染但是痰培養結果提示正常，可能與許多情況相關，主要包括痰液中已無細菌感染，痰培養假陰性以及肺結核痰培養陰性等情況相關，具體分析如下：
1、痰液中已無細菌：例如肺炎的患者在病情已經在很大程度上有所恢復，機體可以產生一定的免疫力，清除少量入侵的細菌及病毒；此時用痰培養這種檢查方法已經檢測不到病菌的存在，因此結果會呈現陰性，但是患者肺部感染并未完全恢復。一般來說只需堅持用藥到達足療程，就可以達到痊愈。
2、痰培養假陰性：在做痰培養的時候，患者之前或正在使用抗生素，抗生素導致痰培養的病原學產生假陰性，也就是本身有感染卻不能夠在痰培養檢測中檢測出陽性結果，這種情況下要根據臨床經驗來治療，不能認為感染已經完全控制。
3、肺結核痰培養陰性：肺結核的患者如果痰培養陰性，說明培養的痰液中沒有結核菌，但此時不能代表沒有肺結核。痰液結核菌培養受多種因素影響，比如留取的痰標本是否合格、培養時間是否充足、培養方法是否準確等，因此在臨床上，痰結核菌培養陽性的概率大約是30%左右，確診肺結核通常需要不止一次的行痰結核菌培養。同時，還需要結合患者臨床癥狀、PPD試驗、肺部影像學、痰基因檢測等綜合考慮。