早上起床有眼屎可能是生理因素導致，也可能是病理因素導致，如倒睫、角膜炎、結膜炎、上火、其他原因，可以吃食物和藥物來進行治療，改善眼部的不適癥狀。
一、生理因素：如果睡眠不足或用眼過度會刺激眼球分泌物增加，而且當眼睛過于干澀時，也會刺激腺體分泌更多的油脂用于潤滑眼部，從而出現早上起床有眼屎的情況，一般注意休息、保持充足的睡眠后可緩解。不健康的飲食習慣可以使身體缺乏微量元素及維生素，造成眼部營養不足，血液循環受限，出現早上起床有眼屎、眼睛干澀的情況，平時可以吃含有營養的食物來緩解，如蘋果、柚子、白菜、菠菜等。
二、病理因素：1、倒睫：如果自身存在倒睫，由于睫毛向后生長會觸及眼球，眼球在受到摩擦刺激后會造成分泌物增加，導致早上起床有眼屎，還可能有畏光、流淚的癥狀，可以通過物理拔除或者冷凍治療緩解，平時可以吃一些新鮮蔬菜、水果，如菠菜、奇異果，有利于眼部的健康；
2、角膜炎、結膜炎：多由于眼部衛生清潔不佳，使病菌侵入眼部，引發感染后產生炎性分泌物，潴留在眼角或眼瞼部位，從而出現早上起床有眼屎的情況，并伴有眼紅、眼澀等癥狀，可以遵醫囑吃更昔洛韋分散片、阿昔洛韋片等藥物緩解癥狀；
3、上火：通常是人體陰陽失衡后出現的內熱證候，內火上炎從而引發早上起床有眼屎的現象，并伴有食欲不振、頭暈等癥狀，注意飲食清淡即可；
4、其他原因：如果晚上睡覺時接觸過敏原或者被褥材質刺激到眼部，發生變態反應，則可能會導致分泌物增多，出現早上起床有眼屎的情況，可遵醫囑使用妥布霉素地塞米松滴眼液、氧氟沙星滴眼液等藥物治療，也可口服氯雷他定片、鹽酸西替利嗪片等藥物緩解癥狀。
建議在平時生活中多注意休息，調整不良生活規律，多進行體育活動，如慢跑、散步等，出現眼部不適時及時去醫院眼科就診，完善血常規檢查、裂隙燈檢查等明確病因。