一般而言，嬰兒化驗大便通常不可以用尿不濕上的，否則可能會影響檢驗結果。建議在進行采樣時，一定要在醫生指導下進行，切不可盲目采樣。當嬰兒出現嘔吐、腹瀉、發熱等癥狀時，為了判斷或排除是否存在胃腸道疾病，尤其是感染性胃腸道疾病，如急性胃腸炎等，都會采集嬰兒大便進行化驗來輔助診斷。
采集大便標本時，通常需要采取新鮮的標本，以保證標本不被外界污染，導致化驗結果出現異常，而尿不濕上的大便通常不是新鮮的，且穿過一段時間的尿不濕中還可能存在其他雜菌，繼而可污染大便標本，導致大便化驗的結果出現異常，不利于疾病的診斷。所以不能為了圖方便、快捷，繼而隨意采樣，以免影響醫生判斷疾病，也不利于疾病后續的指導治療。而除了采集大便標本外，采集小便標本等也需要新鮮的標本，以保證化驗結果的準確性。
若是大便化驗結果正常，則可排除大多胃腸道疾病，不必過于擔心。而若是結果異常，如檢查存在細菌等，則說明可能存在胃腸道炎癥感染。此時，則需要及時在醫生的指導下進行相應治療，如遵醫囑使用雙歧桿菌活菌散等改善胃腸道功能。