正常尿液中一般無菌，因此當尿培養出大腸埃希菌，提示可能存在尿液標本污染或泌尿道感染的情況，需要根據細菌數量、臨床癥狀等明確。
1、尿液標本污染：尿培養主要留取抗生素應用前的中段尿進行培養，收集尿標本的方式有自行排尿、導尿、恥骨上穿刺抽吸等，在自行排尿的標本收集中容易受到外界污染，導致尿培養假陽性。尿培養出大腸埃希菌后，需通過菌落計數的方式進一步判定尿液被污染的可能性。臨床上常以尿培養細菌菌落計數≥10^5CFU/ml作為判定尿路感染的診斷指標，而當尿培養細菌菌落計數小于10^4CFU/ml，則提示污染的可能性較大；
2、泌尿道感染：對于泌尿道感染的診斷，除尿培養出大腸埃希菌外，還需結合患者有無臨床癥狀和體征、尿常規等進行綜合判定。對于尿路感染大腸埃希菌的患者，如患者合并有泌尿道感染癥狀，如尿頻、尿急、尿痛、恥骨上區不適、腰骶部疼痛等，或者尿常規檢查出白細胞尿、血尿、蛋白尿等，則可基本診斷為泌尿道感染。需要進一步進行藥物敏感試驗，明確具體哪些藥物對培養出的大腸埃希菌更敏感，從而選擇最適合的藥物進行抗感染治療，如環丙沙星、羅紅霉素等。