石斛明目丸和石斛夜光丸的區別在于兩者的成分、功效以及適用人群，建議患者到中醫科就診，在醫生指導下選擇合適的藥物，切勿自行選用或隨意與其他藥物聯用。
1、成分：石斛明目丸、石斛夜光丸中都有石斛、青葙子、決明子、蒺藜、地黃、枸杞子、菟絲子、肉蓯蓉、人參、山藥、天冬、麥冬、五味子、甘草、菊花、牛膝等，但前者還有石膏、磁石等，后者則有羚羊角。
2、功效：石斛明目丸能夠平抑肝陽、清肝火，并滋補腎臟、明目等。而石斛夜光丸則能滋補陰液、補益肝腎，并明目、除翳、理氣等。
3、適用人群：石斛明目丸主要用于肝腎虧虛、陰液虧虛而虛火旺盛所致的視物昏花、精神疲憊等，可改善老年性白內障、視神經萎縮等。而石斛夜光丸雖然也能用于肝腎虧虛，但主要是改善患者畏光、流淚、視物模糊等。
臨床使用石斛明目丸和石斛夜光丸時，都需要注意風熱侵襲肝經、肝火向上侵擾等人群不能使用，而孕婦、脾胃虛弱者應當謹慎使用，以免加重軀體不適。期間還應注意清淡飲食，避免吃油膩、辛辣的食物。