男性器官上面長小白點可能是生殖器皰疹、尖銳濕疣，也可能是毛囊炎引起的小白點，需要明確病因后采取針對性的治療措施。
1.生殖器皰疹：男性的生殖器上面會出現長水泡的癥狀，還有可能會伴隨疼痛，甚至會導致皮膚長小白點。可以在醫生的指導下使用阿昔洛韋凝膠、鹽酸伐昔洛韋片等藥物進行治療，有利于疾病的恢復。
2.尖銳濕疣：當受到人乳頭瘤病毒的入侵之后，也有可能會給生殖器官帶來一定的損傷，出現生殖器官上長小白點的情況。可以遵醫囑使用咪奎莫特乳膏、重組人干擾素α2b凝膠等藥物進行治療，也可以進行激光治療。
3.毛囊炎：生殖器部位受到細菌等致病菌的入侵之后，可能會導致毛孔受到損傷，出現長小白點、紅腫疼痛的癥狀，可以使用莫匹羅星軟膏、紅霉素軟膏等藥物進行治療。
日常生活中要注意局部的衛生，勤換內褲。