碳化灸和艾柱灸區別在于在燃燒的時候碳化灸無煙，而艾柱灸會產生煙霧，同時碳化灸適合于煙霧敏感的人，也可以做頭面部的針灸，建議患者遵醫囑使用。
碳化灸主要是有艾葉碳化之后得來的物質，具有艾葉的功效。其直接作用于頭面部，相比艾柱能避免產生煙霧，防止出現嗆咳，同時也可以起到活經止痛以及活血通絡的作用。
艾柱灸主要是通過燃燒艾草條或者是艾草柱的方式，直接作用于穴位部位起到消腫散結的作用。在燃燒的時候會產生煙霧，需要在身體其他部位做艾灸改善，并不可以作為頭面部的艾灸改善，避免對呼吸系統造成刺激引起嗆咳。