會厭囊腫有可能會自己消失，也有可能不會自己消失，取決于具體的情況。

會厭囊腫是指由于會厭黏膜的黏液腺管受阻，使黏液潴留其中，形成囊性腫物，癥狀輕時無明顯表現，重時有不適或異物感。

患者可能是進食堅硬的食物，劃傷會厭黏膜，導致會厭黏膜出現損傷，使黏液腺管堵塞，從而形成會厭囊腫，此時癥狀不嚴重。患者通過調整飲食習慣，或者遵醫囑服用阿莫西林膠囊、甲硝唑片等藥物來抑制炎癥吸收，此時會厭囊腫可能會自行消散。

會厭囊腫是生長在會厭部位的良性囊腫，也可能由于長時間的炎癥刺激，導致囊腫的體積逐漸的增大，出現高度水腫，嚴重阻塞呼吸道，有可能會發生窒息，使患者的血壓會迅速下降，導致昏厥、休克等，此時無法自行消失。

患者可以入院采取會厭囊腫切除手術進行治療，手術時會將囊腫以及周圍的黏液腺一并切除，基本能夠達到治愈的目的。