三歲孩子半夜老是哭鬧可能是消化不良、缺鈣、缺乏維生素D等原因導致的，建議在醫生的指導下對癥治療，具體內容如下：
1.消化不良：如果三歲孩子飲食不當，可能會出現上腹痛、腹脹、噯氣等消化不良癥狀，從而難以入睡，并且半夜老是哭鬧。建議家長在醫生的指導下給三歲孩子使用藥物治療，常用藥物有多潘立酮片、干酵母片、健胃消食片等。
2.缺鈣：缺鈣可能會影響三歲孩子的睡眠質量，從而出現半夜老是哭鬧的情況。建議家長在醫生的指導下給三歲孩子使用藥物治療，常用藥物有葡萄糖酸鈣口服溶液、氯化鈣注射液、牡蠣碳酸鈣片等。
3.缺乏維生素D：維生素D是一種脂溶性維生素，孩子缺乏維生素D可能出現煩躁不安、難以入睡等情況，所以三歲孩子半夜老是哭鬧可能是缺乏維生素D導致的。建議家長在醫生的指導下給三歲孩子使用維生素D2軟膠囊、維生素D滴劑、碳酸鈣D3顆粒等藥物進行治療。