克雷伯菌主要包括肺炎克雷伯菌肺炎亞種、鼻炎克雷伯菌臭鼻亞種、鼻硬結克雷伯菌硬結亞種等，感染后分別可引起肺炎克雷伯菌肺炎、萎縮性鼻炎、鼻硬結癥等疾病。通常情況下，不同種類的克雷伯菌感染需要治療的時間不同。
1、肺炎克雷伯菌肺炎亞種：感染后引起的肺炎克雷伯菌肺炎的患者，如果病情比較輕微，沒有嚴重的基礎疾病、沒有長期使用抗菌藥物，身體免疫系統功能相對比較好，根據臨床經驗分析，可能在連用10-14天抗菌藥物治療后能治好。感染肺炎克雷伯菌后如果在肺部出現廣泛、多發的病灶，病情比較嚴重，連用3周及以上的抗菌藥物治療后，有可能治好；
2、鼻炎克雷伯菌臭鼻亞種：感染后會引起萎縮性鼻炎，經過遵醫囑使用鹽酸左氧氟沙星注射液、硫酸奈替米星注射液、丹參注射液等藥物治療后，臨床上體質較好、病情較輕的患者可能在3-4周后能治好。體質較弱或鼻塞、頭昏等癥狀較重者，可能需要兩個月左右時間才能治好；
3、鼻硬結克雷伯菌硬結亞種：鼻硬結癥是一種慢性進行性的肉芽腫病變，患者可遵醫囑使用注射用頭孢曲松鈉、硫酸卡那霉素注射液、注射用硫酸鏈霉素等藥物治療。根據臨床經驗，一般在2-3周能治好。