兒童輕微鼻塞不能打流感疫苗，建議等身體恢復后再打比較好，以免影響流感疫苗的接種效果，或是加重兒童的不適癥狀，反而不能達到原本的目的。
流感疫苗多由人工滅活的病原微生物制成的免疫制劑，通常當機體打完流感疫苗后，會發生相應的免疫反應，從而形成抗體，達到對流感病毒的免疫作用，期間可能出現輕微發熱、咳嗽等不適。而兒童出現輕微鼻塞多與病毒或細菌等感染引起的呼吸系統疾病等有關，如感冒、鼻炎、肺炎等。在疾病未恢復期間，由于兒童的免疫力較低，若在此時打流感疫苗，導致機體無法及時產生相應的免疫反應，就可能會影響該疫苗的接種效果。還可能會誘發或加重兒童的不適癥狀，如機體發熱、咳嗽、食欲減退等。
建議兒童在患病期間注意做好保暖措施，適當多飲用溫水，清淡飲食，適當增加營養的攝入等，屋內定時開窗通風，以促進身體的恢復。此外，在機體恢復后建議詢問醫生是否可以打流感疫苗，明確可以之后再去打流感疫苗。