小腸出血有多種方法進行檢查，常見的有血管造影檢查、放射性核素顯像、膠囊內鏡檢查、雙氣囊內鏡檢查、小腸鋇灌檢查等。使用何種方法檢查，需根據病情、患者的需求來決定，具體如下：
1、血管造影檢查：小腸出血時，可選擇血管造影檢查。只要看到造影劑外滲即可做出明確診斷，并同時進行栓塞治療。但此項檢查受失血速度和檢查時機影響。
2、放射性核素顯像：是小腸出血的局部非侵入性的檢查，診斷準確率高，為非創傷性檢查，無副作用，少量出血即可檢測出，主要用于小腸出血的定位，其敏感性強于血管造影。但是其陽性率不如血管造影高。
3、膠囊內鏡檢查：在不能明確小腸出血的情況，可以選擇該檢查。膠囊內鏡具有安全、無創、依從性好，臨床確診率高等特點，但也是有缺點的，無法進行病理檢查和內鏡下治療。
4、雙氣囊內鏡檢查：該檢查比膠囊內鏡更具備完善的檢查優勢，比膠囊內鏡診斷準確率高，小腸出血能直接診斷。不過做該項目檢查時間較長，對患者來說較為痛苦。
5、小腸鋇灌檢查：其檢查能直接顯示小腸病變的區域和范圍，一般適用于慢性出血的患者。