龜頭長小痘痘碰到會疼可能是毛囊炎、龜頭炎、珍珠樣陰莖丘疹、生殖器皰疹、傳染性軟疣等原因引起的，可以通過藥物治療、物理治療進行治療。
1、毛囊炎：當龜頭部位的毛囊發生感染后，可能會引發毛囊炎。在炎癥的刺激下可出現局部疼痛的現象，同時還可出現長小痘痘的情況。可以遵醫囑外用紅霉素軟膏、夫西地酸乳膏、莫匹羅星軟膏等藥物進行緩解。
2、龜頭炎：如果不注意個人衛生，很容易被細菌、真菌等病原菌感染，導致龜頭炎。在炎癥的刺激下，患者的局部皮膚和黏膜受到損傷。隨著病情逐漸惡化，局部可能會出現水皰和疼痛的現象。可以在醫生的指導下服用阿奇霉素片、頭孢拉定膠囊、阿莫西林膠囊等藥物進行緩解。
3、珍珠樣陰莖丘疹：屬于良性病變，表現為球形丘疹。當發生二次感染時可能出現發紅和疼痛的癥狀。可以在醫生的建議下服用頭孢克肟膠囊、左氧氟沙星片、頭孢呋辛酯片等藥物進行緩解。
4、生殖器皰疹：是由單純皰疹病毒感染引起的，病毒感染后，會在龜頭和陰囊等部位引起水皰或皰疹樣的皮疹。這些皰疹可出現疼痛、瘙癢和灼熱感等癥狀，并且會破裂形成潰瘍，疼痛是病變的刺激和炎癥反應導致的。可以遵醫囑服用鹽酸伐昔洛韋片、阿昔洛韋片、泛昔洛韋片等藥物進行緩解。
5、傳染性軟疣：病毒會導致皮膚和黏膜上的病變，形成軟質、顆粒狀或菜花狀的疣狀病變。龜頭上出現小痘痘可能是傳染性軟疣的表現之一，這些痘痘通常是無痛的，但在摩擦或碰觸時可能感到不適或疼痛。可以通過冷凍療法、激光療法的方法進行改善。
除上述常見原因外，還可能有其他，比如尖銳濕疣、淋病等。建議如有不適癥狀，應該及時就醫進行檢查。