微刺激方案并不是都不能進行鮮胚移植。移植即試管嬰兒輔助生殖體外受精－胚胎移植技術，鮮胚移植即促排當月獲得的新鮮胚胎移植。若胚胎、母體各方面都比較合適，則可以進行鮮胚移植，但是若存在胚胎數量較少、胚胎內膜不同步、卵巢過度刺激等原因時，則不建議移植鮮胚。
1、胚胎數量較少：微刺激方案是控制性超促排卵的一種方式，相對比較溫和，用藥時間短、劑量小，適合卵巢功能較差的人群，但若卵子數量較少，可利用胚胎數量也較少，因此在促排當月沒有足夠可移植胚胎時，會進行胚胎凍存，取消鮮胚移植；
2、胚胎內膜不同步：微刺激方案多會用到氯米芬，氯米芬有拮抗雌激素作用，可導致內膜偏薄，引起子宮內膜容受性改變。另外，若取卵前孕酮升高，也可導致子宮內膜種植窗提前關閉，造成胚胎內膜不同步，鮮胚移植成功率會明顯下降，因此不能移植鮮胚；
3、卵巢過度刺激綜合征：雖然微刺激方案比較溫和，但仍可能發生卵巢過度刺激綜合征，常有腹痛、腹脹等不適，若鮮胚移植可加重卵巢過度刺激綜合征癥狀，從而影響鮮胚移植成功率，因此不能移植鮮胚。