藥流失敗如果經過檢查明確孕囊仍在宮腔內，通常可以進行無痛人流將孕囊取出。但建議選擇正規醫院進行手術操作，并且圍手術期還應積極預防感染。
藥流成功率通常較高，如果藥流后孕囊未及時排出，可能與身體對藥物敏感性較低有關，此時可在醫生指導下應用宮縮類藥物或加大流產藥物劑量。如果孕囊仍未排出，則提示藥流失敗，可在醫生指導下完善腹部超聲等檢查，然后進行無痛人流操作，取出孕囊。無痛人流術是在普通人流的基礎上輔以靜脈麻醉，在無痛狀態下進行流產手術，術前需要完善凝血功能、心電圖等相關檢查。由于藥流失敗后再進行無痛人流的感染幾率會有所增加，所以可在術前遵醫囑使用抗生素類藥物預防感染。同時術中需注意無菌操作，術后可遵醫囑使用促進宮縮的藥物治療，促使宮腔內的殘留物排出。
如果藥流失敗，必須及時處理，以免引起大出血、宮腔感染、宮腔粘連、凝血功能障礙等嚴重并發癥。