如果是遵醫囑適量用合歡花泡水喝，一般沒有害處；如果未遵醫囑過量用合歡花泡水喝，可能有害處，包括腹瀉、腹痛。
合歡花是中藥材，具有解郁安神、理氣開胃、消風明目、活血止痛的功效，主治憂郁失眠、腰癰、跌打傷痛等，遵醫囑用藥泡水喝，有較好的療效，一般不存在明顯害處。
如果未遵醫囑擅自用藥泡水喝，可能會刺激胃腸道黏膜，引起腹瀉、腹痛的消化系統的不良反應，還可能會導致肝臟的代謝負擔增加，誘發肝損傷。患者在用藥期間需要定期復查，避免用藥損傷的出現。