慢性結腸炎屬于良性病變，通過積極治療后控制癥狀，一般不會影響患者壽命。但是有少數患者治療不及時，可能出現嚴重的并發癥，如大出血、腸穿孔、腸梗阻等，此時若處理不及時則可能會影響壽命。
對于慢性結腸炎患者，如果腸鏡下顯示結腸炎癥狀較輕，未出現明顯的潰瘍面，可遵醫囑應用抗生素、糖皮質激素類藥物，以及免疫調節劑等藥物進行治療，一般預后較好，通常不會影響壽命。此外，少數潰瘍性結腸炎或克羅恩病的患者，若應用藥物后癥狀緩解不明顯，癥狀進一步嚴重，可出現便血、腸梗阻的情況，如果手術治療及時，患者仍然可以保持正常壽命，但是如果出現不可控制的消化道大出血且處理不及時，則可能會影響壽命。
因此，確診慢性結腸炎后應積極遵醫囑進行治療，以減小對生命健康的影響。另外，患者在日常生活中還應注意休息，避免過度焦慮，避免辛辣刺激飲食，定時服藥，按時遵醫囑進行復查。