沙門氏菌并不是一種細菌，而是一個細菌屬，其中包含傷寒沙門氏菌、非傷寒沙門氏菌、副傷寒沙門氏菌等，感染沙門氏菌后，出現臨床癥狀所需要的時間，通常與感染的具體菌種有關。
1、傷寒沙門氏菌：感染傷寒沙門氏菌可引起傷寒，特點是巨噬細胞侵入小腸黏膜，并擴散引起系統性疾病，可出現血液感染、發熱、腹痛等癥狀，患者的潛伏期一般為1-2周，即1-2周后可出現癥狀；
2、非傷寒沙門氏菌：是指傷寒、副傷寒以外的沙門氏菌感染所引起的疾病，特點是大量白細胞侵入結直腸以及小腸黏膜。胃腸炎型潛伏期比較短，通常在4-48小時內就會出現癥狀，而類傷寒型非傷寒沙門氏菌病，或敗血癥型非傷寒沙門氏菌病潛伏期比較長，一般在感染1-2周后，才會出現臨床癥狀，如發熱、腹部絞痛等；
3、副傷寒沙門氏菌：副傷寒沙門氏菌也會侵襲腸道黏膜，只是腸壁病變比較表淺，較少出現腸出血或腸穿孔的現象，其主要特點是潛伏期比較短，大部分患者感染副傷寒沙門氏菌后8-10天出現臨床癥狀，主要表現為腹脹、腹瀉、食欲不振，并且患者的體溫上升比較快，容易出現高熱的癥狀。